超聲波細胞破碎儀是用來進行細胞破碎的超聲波實驗儀器，主要工作原理為超聲波的空化作用。為了延長超聲波細胞破碎儀的使用壽命，在使用超聲波細胞破碎儀應注意以下事項。
一、開機前務必將超聲探頭（超聲波變幅桿）插入樣品，切忌空載。
二、超聲波變幅桿（超聲探頭）入水深度應在1.5cm左右，液面高度最好有30mm以上，探頭應居中放置，不可貼壁。超聲波是垂直縱波，插入太深不容易形成對流，影響破碎效率。
三、超聲參數設置
應按說明書要求設置超聲波細胞破碎儀工作參數，比較敏感的樣品（比如細菌）一般外面采用冰浴，實際溫度肯定是低于25度，蛋白核酸肯定不會變性。
1）工作時間
超聲持續工作時間每次不宜超過5秒，工作間隙時間應大于或等于超聲時間，以便于熱量散發。時間設定應以超聲時間短，超聲次數多原則，可延長超聲波細胞破碎儀以及超聲探頭的壽命。
2）超聲功率
不宜太大，以免樣品飛濺或起泡沫，如小于10ml樣品容量，功率應在200w以內,選用2mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿選擇開關打到相應擋；10-200ml樣品容量的功率在200－400w，選用6mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿打到相應擋；200ml以上的樣品容量功率在300-600w之間，選用10mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿打到相應擋；（2MM的小探頭功率嚴禁超過350W）
3）容器選擇
應根據樣品量選擇容器，不宜選擇過大的燒杯，如20ml的樣品宜選用20ml的燒杯。這樣可有利于樣品在超聲中對流，提高超聲波破碎效率。
四、若實驗中選用1.5ml的EP管盛放樣品，務必將EP管固定好，以防冰浴融化后液面下降導致空載。
五、以上為超聲波細胞破碎儀操作時注意事項，在超聲細胞破碎儀工作完畢后，也應注意將進行清洗保養，可用酒精擦洗探頭或用清水進行清洗。
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